Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpini2-201ENSMUST00000039047 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms