Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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