Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup58Q8R332 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms