Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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