Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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