Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim68Q8K243 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim68Q8K243 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trim68Q8K243 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim68Q8K243 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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