Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Csnka2ipQ8CH19 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Csnka2ipQ8CH19 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Csnka2ipQ8CH19 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Csnka2ipQ8CH19 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Csnka2ipQ8CH19 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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