Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm28Q8CGC6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms