Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms