Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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