Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx17Q8BVL3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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