Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmod1Q8BVA4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms