Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms