Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.3 ms