Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Avl9Q80U56 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Avl9Q80U56 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Avl9Q80U56 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Avl9Q80U56 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Avl9Q80U56 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Avl9Q80U56 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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