Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6aQ78XR0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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