Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msrb2Q78J03 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Msrb2Q78J03 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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