Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms