Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tpm4Q6IRU2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms