Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms