Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrhQ62361 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms