Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trim28Q62318 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trim28Q62318 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trim28Q62318 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim28Q62318 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms