Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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BcanQ61361 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BcanQ61361 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BcanQ61361 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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BcanQ61361 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BcanQ61361 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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