Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfap2bQ61313 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms