Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 619.3 ms