Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms