Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms