Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Bbs12Q5SUD9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Bbs12Q5SUD9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.8 ms