Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Lin28bQ45KJ6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Lin28bQ45KJ6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28bQ45KJ6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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