Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp48Q3V0C5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp48Q3V0C5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp48Q3V0C5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Usp48Q3V0C5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp48Q3V0C5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp48Q3V0C5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms