Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms