Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms