Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Znf48Q3US17 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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