Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms