Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps110-201ENSMUST00000117530 1094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms