Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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