Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms