Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ulk3Q3U3Q1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms