Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms