Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Col24a1Q30D77 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Col24a1Q30D77 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms