Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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