Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Rpusd2Q149F1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms