Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
StumQ0VBF8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms