Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Calb2Q08331 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Calb2Q08331 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms