Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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