Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms