Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Apoc2Q05020 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Apoc2Q05020 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms