Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms