Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SmsP97355 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SmsP97355 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SmsP97355 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SmsP97355 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SmsP97355 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SmsP97355 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SmsP97355 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SmsP97355 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SmsP97355 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SmsP97355 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SmsP97355 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms