Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms